Pierwszą szkółkę dla dzieci przedszkolnych siostry Służebniczki Najświętszej Maryi Panny otworzyły w Mogilnie jeszcze w zaborze pruskim, w 1914 r.

Zlokalizowały ją w salce parafialnej przy ogrodach farnych, którą ks. Piotr Wawrzyniak przystosował ze stodoły na cele polskiej społeczności. W 1926 r. siostry przeniosły szkółkę do swojego obecnego mieszkania przy Rynku. Wówczas wszystkie pokoje na parterze oraz salka w podwórzu przeznaczone były na cele przedszkola dwuoddziałowego.

Po wybuchu II wojny światowej siostry zostały wyrzucone z budynku przez hitlerowców, którzy urządzili tam Kindergarden dla 50 niemieckich dzieci. Siostry na nowo musiały po wojnie urządzać przedszkole, które uruchomione zostało 5 maja 1945 r. - Kiedy przedszkole było w pełnym rozkwicie, dzieci odbierały wychowanie religijne i wykształcenie intelektualne. Rodzice obdarzali wychowawczynie wdzięcznością i zaufaniem. Plany Boże były jednak inne. 15 maja 1952 r. państwo przejęło przedszkole zabraniając siostrom prowadzić ośrodki wychowawcze. Całe wyposażenie przedszkola wraz z karuzelą z podwórka zabrano do powstałego przedszkola państwowego na czas nieograniczony. Lokal w podwórzu zamknięto - opowiada obecna dyrektorka ochronki siostra Martyniana Dembicka.

W 1957 r. przełożoną domu była siostra Łucja Ratajczak. W lipcu 1957 r. wydział oświaty zwrócił salę dawniejszego przedszkola w podwórzu i przystąpiono do jej remontu. Wydział oświaty zwrócił również zabrane w 1952 r. meble przedszkolne, choć już w podniszczonym stanie. Siostry urządziły punkt katechetyczny dla dzieci przedszkolnych. W latach 60. ubiegłego wieku była już tylko katecheza przedszkolna przygotowująca dzieci do wczesnej komunii oraz szkolna.

Funkcjonowanie Ochronki im. błogosławionego Edmunda Bojanowskiego na nowo w 2002 r. zorganizowała siostra przełożona Alfreda Czajka. Od 2005 r. ochronka jest wpisana do ewidencji szkół i placówek niepublicznych przez burmistrza Mogilna pod nazwą Niepubliczne Przedszkole Ochronka Zgromadzenia Sióstr Służebniczek Niepokalanego Poczęcia Najświętszej Maryi Panny.

Organem prowadzącym jest Dom Zakonny Sióstr w Konstancinie. Pierwszą wychowawczynią była siostra Angelika Furmańska, następnie siostra Antonina Kalka, która również była dyrektorką. Od 2006 r. wychowawczynią i dyrektorką mogileńskiej ochronki jest siostra Martyniana Dembicka, która pełni także obowiązki Przełożonej Domu Sióstr Służebniczek Maryi w Mogilnie.